У 1974 р. молодий спеціаліст розпочав трудове становлення в науково-виробничій організації «Електроприлад» (нині Науково-виробниче підприємство «Хартрон-Аркос»). До 1991 р. послідовно обіймав посади інженера відділу випробувань бортової апаратури систем управління ракет-носіїв та космічних апаратів, старшого інженера відділу випробувань апаратури, провідного інженера відділу випробувань та супроводження ракет-носіїв (РН) «Енергія» з космічним апаратом «Скіф», начальника сектора відділу випробувань та супроводження РН «Енергія» та пілотованого орбітального корабля «Буран». Заслужений авторитет Бориса Ілліча і його висока компетентність сприяли вирішенню численних виробничих питань, що в подальшому зумовило його призначення на керівні посади. Так, у 1991–1992 рр. Б.І. Батирєв – заступник начальника відділу випробувань бортової апаратури різноманітних систем управління РН і космічних апаратів. У 1992–1993 рр. очолив цей відділ. Брав безпосередню участь у розробці автоматизованих систем управління технологічними процесами (АСУ ТП) для атомних електростанцій.
Під його керівництвом введений у промислову експлуатацію пульт технічного контролю апаратури відображення і протоколювання параметрів системи управління і захисту реактора на енергоблоках Рівненської АЕС, виготовлені перші комплекти апаратури системи управління «Циклон-4», освоєно виготовлення цифрового обчислювального комплексу для системи управління ракети-носія «Рокот М». Борис Ілліч взяв участь в успішних запусках ракет-носіїв «Циклон-2», «Циклон-3» з першим українським супутником «Січ-1», ракет-носіїв «Рокот» та «Дніпро» з різноманітними космічними апаратами на основі систем управління, розробленими в
НПП «Хартрон-Аркос».
На допомогу студентам-початківцям Б.І. Батирєв видав два навчальних посібники: «Експериментальне відпрацювання систем управління об’єктів ракетно-космічної техніки» (2008) та «Експериментальна база НПП «Хартрон-Аркос» (2012). На сьогодні бере активну участь у програмах «Циклон-4», «Таурус-ІІ», РН «Рокот» з різноманітними космічними апаратами (КА), РН «Дніпро-1» з різноманітними КА.
Під керівництвом Бориса Ілліча створена технологія укомплектування апаратури і кабельної мережі ракетоносія новими приладами в умовах космодрому із забезпеченням мінімальних матеріальних затрат. За внесок у роботу «Створення і експлуатація ракетно-космічного комплексу «Дніпро» Б.І. Батирєв був заслужено відзначений Державною премією України в галузі науки і техніки.
За безпосередню участь і особистий внесок у справу освоєння космічного простору Борис Ілліч нагороджений медалями: ім. Ю.В. Кондратюка (О.Г. Шаргея) Федерації космонавтики; «За творчий внесок у створення засобів наземної космічної інфраструктури»; ім. академіка В.М. Челомея Асоціації космонавтики Росії. Також відзначений пам’ятною медаллю «45 років 13-й Краснознаменной Оренбургской дивизии».
Розуміння успіху повною мірою відчуваєш тоді, коли маєш із ким його розділити. Протягом 40 років вірною супутницею життя, натхненницею, порадницею і другом Бориса Ілліча є його дружина – Людмила Валентинівна – колишній працівник підприємства, нині перебуває на заслуженому відпочинку.